避免使用.htaccess文件有两个主要原因。
首先是性能。如果AllowOverride启用了.htaccess文件，则Apache需要在每个目录中查找.htaccess文件，因此，无论是否真正用到，启用.htaccess都会导致性能的下降。另外，对每一个请求，都需要读取一次.htaccess文件。
还有，Apache必须在所有上级的目录中查找.htaccess文件，以使所有有效的指令都起作用(参见指令的生效)，所以，如果请求/www/htdocs/example中的页面，Apache必须查找以下文件：
/.htaccess
/www/.htaccess
/www/htdocs/.htaccess
/www/htdocs/example/.htaccess
总共要访问4个额外的文件，即使这些文件都不存在。(注意，这可能仅仅由于允许根目录”/”使用.htaccess ，虽然这种情况并不多。)
其次是安全。这样会允许用户自己修改服务器的配置，这可能会导致某些意想不到的修改，所以请认真考虑是否应当给予用户这样的特权。但是，如果给予用户较少的特权而不能满足其需要，则会带来额外的技术支持请求，所以，必须明确地告诉用户已经给予他们的权限，说明AllowOverride设置的值，并引导他们参阅相应的说明，以免日后生出许多麻烦。
注意，在/www/htdocs/example目录下的.htaccess文件中放置指令，与在主配置文件中
/www/htdocs/example目录下的.htaccess文件：
/www/htdocs/example目录下的.htaccess文件的内容：
AddType text/example .exm
httpd.conf文件中摘录的内容：
AddType text/example .exm
但是，把配置放在主配置文件中更加高效，因为只需要在Apache启动时读取一次，而不是在每次文件被请求时都读取。
将AllowOverride设置为none可以完全禁止使用.htaccess文件：
AllowOverride None